Основная масса тюркских имен и прозвищ была принесена на Русь татаро-монголами - выходцами из Золотой Орды - в конце XIV-XV века. Фамилия Ганеев образована от мусульманского мужского имени Ганей, распространенного у татар и башкир. Имя Ганей, предположительно, представляет собой татарский вариант имени Гани, которое в переводе с арабского означает «очень богатый, состоятельный». Слово «гани» входит в число 99 имен-эпитетов Аллаха, а богатство и материальное благополучие являются, таким образом, благами божественного свойства.
По другой версии, Ганей — это производная форма имени Ганя, которое, в свою очередь, ведет начало от православного имени Гавриил. Само имя Гавриил имеет древнееврейские корни, а на русский язык переводится как «божественный воин».
В христианстве одним из святых покровителей этого имени является Архангел Гавриил - ангел, открывший тайное знание Бога, сообщивший Деве Марии благую весть о Рождении Иисуса Христа (Благовещение) и ее смерти, а Мухаммеду — Коран (Ночь предопределения). Архангел Гавриил часто изображался на северных дверях иконостаса. Также он — один из щитодержателей на Гербе Российской империи.
В случае славянского происхождения фамилии основатель рода Ганеевых, скорее всего, был человеком из простого сословия. Дело в том, что полными именами звались в основном представители социальной верхушки, знати или семей, пользовавшихся в данной местности большим авторитетом. Выходцев же из других сословий, как правило, звали уменьшительными, производными именами. Как правило, это были русские суффиксы принадлежности -ов/-ев, -ин. Таким образом, потомок человека, которого звали Ганей, со временем получил фамилию Ганеев.
